Stoffen die niet in je lichaam thuishoren heetten lichaamsvreemde stoffen of antigeen. Je lichaam verdedigt zich tegen zulke stoffen. Zulke stoffen kunnen je lichaam binnen komen door bijvoorbeeld: infecties, bloedtransfusies en orgaantransplantaties. Bij een infectie drongen ziekteverwekkers je lichaam binnen dit kunnen bijvoorbeeld bacteriën, schimmels of dieren zoals insecten zijn. Voetschimmel en kalknagels wordt bijvoorbeeld veroorzaakt door schimmels.

Je lichaam is in meeste gevallen goed beschermt tegen het binnen dringen van ziekteverwekkers. De opperhuid is zo gebouwd dat ziekteverwekkers er niet gemakkelijk doorheen kunnen. Een laagje talg op de huid gaat aantasting van de opperhuid door ziekteverwekkers tegen. Ook het slijmvlies in de wand van de luchtwegen en van het darmkanaal is zo gebouwd dat ziekteverwekkers er niet gemakkelijk doorheen kunnen.